SD Tabita Puri didirikan pada tahun 2012 di bawah naungan lembaga Madinatul Ilmi. Namun sejak 30 Mei 2014, SD Tabita Puri berada di bawah naungan Yayasan Tabita Puri. Perubahan tersebut berdasarkan pada Lampiran kesepakatan hasil rapat antara pihak lembaga Madinatul Ilmi dengan pihak keluarga Sdr. Zidniyati. Dalam kesepakatan tersebut dinyatakan adanya perubahan pengelola SD Tabita Puri yang awalnya berada di bawah naungan lembaga Madinatul Ilmi melimpah pada Yayasan Tabita Puri. Yayasan Tabita Puri disahkan berdasarkan Salinan Akta Yayasan Tabita Puri bernomor 20 tanggal 13 Maret 2015 dengan notaris Agus Salim, S.H., M.KN. dan disahkan dengan Keputusan Menteri Hukum dan Hak Asasi Manusia Republik Indonesia dengan nomor AHU-0003832.AH.01.04.TAHUN 2015. Sehingga sejak 30 Mei 2014 SD Tabita Puri berada di bawah naungan Yayasan Tabita Puri.

  Sesuai dengan visi dan misi sekolah, sejak tanggal 28 November 2017, SD Tabita Puri mendapatkan Ijin Penyelenggaraan Pendidikan Inklusif dari Kepala Dinas Pendidikan Kabupaten Banyuwangi.